Fortalecendo a saúde vegetal por meio de abordagens avançadas de sequenciamento
Por: Tatiana Mituti e Joseane Carvalho.
O diagnóstico fitossanitário tem se beneficiado de um conjunto integrado de tecnologias moleculares capazes de oferecer maior precisão, rapidez e sensibilidade na detecção de pragas e patógenos vegetais. Entre essas ferramentas, destacam-se o sequenciamento Sanger, a análise de fragmentos por eletroforese capilar, sequenciamento de Nova geração (NGS), que inclui o sequenciamento por nanoporos, e que quando combinados, ampliam o alcance e a eficiência dos programas de vigilância e manejo fitossanitário.
A análise de fragmentos por eletroforese capilar possibilita a detecção de polimorfismos, perfis multialvo e variantes de patógenos. Amplamente utilizada em multiplex PCR e em estudos de diversidade genética em plantas, essa técnica é essencial para rastrear populações de fitopatógenos, diferenciar espécies e raças de difícil identificação morfológica e identificação de pureza genética em cultivares e variedades de plantas.
Uma das principais mudanças vem do uso crescente do NGS, uma tecnologia capaz de sequenciar DNA ou RNA de forma massiva e em alta velocidade. O NGS permite detecção simultânea de múltiplos patógenos (metagenômica/metabarcoding), identificação de organismos emergentes, monitoramento genômico de variantes genéticas, identificação de bactérias, fungos, vírus, nematóides, insetos e ácaros e outros agentes causais de doenças por meio de sequenciamento de genoma e diagnóstico direto em tecidos vegetais complexos, bem como análises mais específicas como o transcritoma para avaliar o padrão global de expressão de genes em plantas ou qualquer outro organismo (resistência/susceptibilidade de plantas à fitopatógenos, resposta de microrganismos ao controle químico e/ou biológico, em ensaios de campo, casa de vegetação ou testes in vitro). Com maior profundidade analítica e redução contínua de custos, o NGS complementa métodos tradicionais e abre caminho para sistemas avançados de vigilância fitossanitária.
Algumas tecnologias são promissoras para o diagnóstico fitossanitário como o sequenciamento por nanoporo (MinIon), que é uma plataforma que permite a análise de ácidos nucléicos (DNA ou RNA) de forma rápida e portátil, bem como análises de metagenômica/metabarcoding realizadas em diferentes plataformas de NGS. A primeira possui a capacidade de gerar dados em tempo real e identificar múltiplos patógenos simultaneamente e a segunda permite investigar a microbiota completa presente em uma amostra vegetal e/ou de solo.
Embora tecnologias de NGS como o Sequenciamento por Nanoporo dominem as discussões atuais, o sequenciamento Sanger continua sendo um pilar importante no diagnóstico fitossanitário. Sua alta fidelidade na leitura de bases permite análises direcionadas, validação de resultados de NGS, PCR e autenticação de isolados, além de análises de variantes genéticas para descrição de perfis de resistência. Por ser aceito internacionalmente, é um método recomendado em certificações fitossanitárias e auditorias regulatórias, e é amplamente utilizado em análises de rotina.
A evolução dessas ferramentas fortalece a segurança alimentar, aumenta a eficiência produtiva e prepara o setor agrícola para desafios crescentes, como mudanças climáticas, surtos emergentes e intensificação das trocas comerciais. À medida que métodos tradicionais, como Sanger, continuam desempenhando papéis essenciais ao lado das plataformas mais avançadas, o diagnóstico fitossanitário se torna mais completo, robusto e alinhado às demandas modernas.
Sobre a Agronômica
A AGRONÔMICA é um laboratório líder em diagnóstico fitossanitário no Brasil, oferecendo soluções integradas que apoiam a tomada de decisão dos principais players do setor agrícola. Atuamos em todas as etapas da cadeia do agronegócio, com serviços que incluem a identificação de pragas regulamentadas e restritivas, por exigências nacionais e acordos internacionais; diagnóstico de doenças e identificação de microrganismos benéficos; análise de produtos biológicos e inoculantes; testes de eficácia e compatibilidade de defensivos químicos e biológicos, tanto em condições controladas quanto em campo; além de análises físico-químicas e microbiológicas. Todos esses serviços estão alinhados ao nosso compromisso com a sanidade vegetal, a sustentabilidade do setor e a promoção da segurança alimentar.